1979年に放映が開始され、大ブームを巻き起こしたロボットアニメの金字塔「機動戦士ガンダム」。TV、OVA、映画など、さまざまなメディアで続編や番外編が制作され、今もなお絶大な人気を誇るシリーズの2002年放映の新作。ロボット同士のバトルはもちろん、今作はヒューマンドラマにも重点を置いた内容になっている。ザフトと地球連合の開戦から11ヶ月、当初、すぐに連邦の勝利で終わるだろうと思われていた戦いは、膠着状態に陥っていた。中立国オーブの資源衛星ヘリオポリスに住む少年、キラ・ヤマトは、ある時、ザフト軍によるガンダム奪取作戦に遭遇し…。