水谷豊、寺脇康文主演の人気刑事ドラマ初の劇場版。警視庁の窓際部署“特命係”に身を置く２人の刑事、頭脳明晰な杉下右京と熱血漢の亀山薫が、抜群のコンビネーションで史上最大の難事件に挑む。不可解な殺人事件が連続して発生し、杉下右京と亀山薫は、現場に残された謎の記号から一連の事件が同一犯による連続殺人事件であることを突き止める。やがて、捜査一課が手詰まりになる中、右京と薫はわずかな手がかりから犯人の次のターゲットを割り出すことに成功する。しかしそれは、３万人のランナーと１５万人の観衆を人質に取るという前代未聞の大規模テロ計画だったのだが…。