往年の人気SFロボット・アニメ「機動警察パトレイバー」シリーズを実写化した「THE NEXT GENERATION パトレイバー」シリーズの劇場版。テロリスト集団の手に落ちた最新鋭戦闘ヘリと旧型警察用ロボの戦いの行方を描く。監督は引き続き押井守。20世紀末に設立された特科車両二課パトロール中隊、通称“パトレイバー”。しかし、レイバーの衰退とともに活躍の場を失い、いまや解隊の危機。そんなある日、最新鋭の戦闘ヘリ“グレイゴースト”がテロリスト集団に強奪され、首都1,000万人を人質にした大規模テロが勃発する。“見えない戦闘ヘリ”の神出鬼没の攻撃に苦戦を強いられる警察と自衛隊。そこで、お荷物とまで呼ばれた“特車二課”が、警察最後の砦として、テロリストの野望阻止に立ち上がるのだった。